Управление является территориальным органом Федерального казначейства, созданным в границах Херсонской области, и находится в непосредственном подчинении Федерального казначейства. Управление осуществляет казначейское обслуживание исполнения бюджетов бюджетной системы Российской Федерации в соответствии с бюджетным законодательством Российской Федерации.